کانتینرهای صادراتی نیز که در این انفجار دچار خسارت شده‌اند، حاوی قیر و پارافین بوده‌اند که راهی جز سوختن آن‌ها وجود ندارد.  این حادثه تأثیر قابل‌توجهی بر فرآیند واردات و صادرات در این بندر داشته است.

گمرک جمهوری اسلامی ایران اعلام کرده که عملیات اطفا حریق در بندر شهید رجایی در انجام است و مراحل ابتدایی لگه‌گیری نیز هم‌زمان با اطفا هوایی انجام می‌شود. همچنین عملیات جرثقیل‌های بندری برای جداسازی و جابه‌جایی کانتینرها از محل حادثه در بندر رجایی در حال انجام است.

طبق اعلام گمرک، کانتینرهای وارداتی که در این حادثه آسیب دیده‌اند شامل مواد شیمیایی بوده‌اند و کانتینرهای صادراتی که در این انفجار آسیب دیده‌اند نیز شامل قیر و پارافین بوده که چاره‌ای جز سوختن آن نیست و در حال حاضر آتش ادامه‌دار در بندر به دلیل پارافین و قیر موجود در این کانتینرهاست.